Außerdem hängt alles noch vom Betriebssystem ab, den z.B. bei Windows Vista, also wahrscheinlich auch bei Windows 7, braucht man Adminrechte, wenn der MSTS unter C:\Programme installiert ist.
Dann sollte man auch in der Readme.txt (oder ähnlich) genau nachlesen, was man eventuell noch beachten muss.
Ich habe bis jetzt keine Probleme mit einer Installme.bat gehabt, also müsstest du mal sagen, bei welcher Strecke du z.B. Probleme hast.
Du schreibst ja, dass du Elemente von Hand kopierst, also verstehe ich nicht ganz, warum er sie nicht findet.
Heißen deine 6 Standard-Ordner und der Tutorial-Ordner auch noch:
EUROPE1
EUROPE2
JAPAN1
JAPAN2
TUTORIAL ROUTE
USA1
USA2
Diese Ordner müssen sich alle im Unterordner x:\MSTS\ROUTES befinden.
Grüße
Klaus